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水生生物资源恢复态势总体向好。2024年，长江干流单位资源量为2.3千克，比2023年上升9.5%；四大家鱼(青鱼、草鱼、鲢和鳙)在长江中游监利断面卵苗资源量为83.2亿粒(尾)，比2023年上升39.1%，是禁渔前2020年的6.2倍；长江下游刀鲚汛期单位资源量为39.9千克，比2023年上升30.4%，是禁渔前2020年的9.5倍。

物种多样性水平稳步回升。2021至2024年，长江流域累计监测到土著鱼类344种，种类数比禁渔前(2017至2020年)增加36种，其中2024年监测到230种。新监测到长鳍吻鮈和红唇薄鳅等国家二级重点保护水生野生动物。时隔30余年首次在长江发现自然繁殖的胭脂鱼鱼苗、在宜昌和监利江段发现了具有一定规模的鳤产卵场，时隔20余年首次在赤水河赤水市江段监测到鳗鲡。

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